Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Nav1-202ENSMUST00000067414 13117 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms