Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm3543D3Z235 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm3543D3Z235 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Gm3543D3Z235 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3543D3Z235 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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