Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf2A3KGV1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms