Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hacd4A2AKM2 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms