Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Prdm16A2A935 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Prdm16A2A935 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Prdm16A2A935 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Prdm16A2A935 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Prdm16A2A935 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Prdm16A2A935 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prdm16A2A935 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Prdm16A2A935 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Prdm16A2A935 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Prdm16A2A935 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prdm16A2A935 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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