Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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Pramef6A2A8M8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
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Pramef6A2A8M8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pramef6A2A8M8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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