Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms