Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm17190V9GX38 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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Gm17190V9GX38 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm17190V9GX38 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms