Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac5Q9Z2V6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac5Q9Z2V6 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac5Q9Z2V6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac5Q9Z2V6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdac5Q9Z2V6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Hdac5Q9Z2V6 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Hdac5Q9Z2V6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Hdac5Q9Z2V6 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Hdac5Q9Z2V6 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Hdac5Q9Z2V6 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac5Q9Z2V6 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Hdac5Q9Z2V6 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Hdac5Q9Z2V6 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac5Q9Z2V6 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac5Q9Z2V6 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac5Q9Z2V6 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac5Q9Z2V6 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac5Q9Z2V6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Hdac5Q9Z2V6 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac5Q9Z2V6 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac5Q9Z2V6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac5Q9Z2V6 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac5Q9Z2V6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac5Q9Z2V6 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdac5Q9Z2V6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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