Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hdac6Q9Z2V5 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hdac6Q9Z2V5 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hdac6Q9Z2V5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hdac6Q9Z2V5 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hdac6Q9Z2V5 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hdac6Q9Z2V5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hdac6Q9Z2V5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Hdac6Q9Z2V5 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Hdac6Q9Z2V5 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Hdac6Q9Z2V5 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Hdac6Q9Z2V5 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac6Q9Z2V5 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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