Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Lgr5Q9Z1P4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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