Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Cldn9Q9Z0S7 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Cldn9Q9Z0S7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn9Q9Z0S7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms