Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nme3Q9WV85 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms