Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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