Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Kcnip3Q9QXT8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms