Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Rabgef1Q9JM13 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Rabgef1Q9JM13 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Rabgef1Q9JM13 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Rabgef1Q9JM13 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
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Rabgef1Q9JM13 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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