Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tgm1Q9JLF6 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms