Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Mrpl39Q9JKF7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Mrpl39Q9JKF7 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl39Q9JKF7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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