Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ush1cQ9ES64 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ush1cQ9ES64 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms