Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp29Q9ES63 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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