Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Hmg20aQ9DC33 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hmg20aQ9DC33 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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