Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Syde1Q9DBZ9 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms