Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Smg9Q9DB90 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Smg9Q9DB90 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Smg9Q9DB90 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Smg9Q9DB90 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Smg9Q9DB90 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Smg9Q9DB90 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Smg9Q9DB90 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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