Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdzd9Q9D9M4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms