Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Chmp5Q9D7S9 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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Chmp5Q9D7S9 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Chmp5Q9D7S9 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Chmp5Q9D7S9 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Chmp5Q9D7S9 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Chmp5Q9D7S9 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Chmp5Q9D7S9 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Chmp5Q9D7S9 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Chmp5Q9D7S9 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp5Q9D7S9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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