Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ptp4a3Q9D658 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ptp4a3Q9D658 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ptp4a3Q9D658 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ptp4a3Q9D658 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ptp4a3Q9D658 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ptp4a3Q9D658 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ptp4a3Q9D658 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ptp4a3Q9D658 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ptp4a3Q9D658 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ptp4a3Q9D658 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ptp4a3Q9D658 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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