Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc130Q9D516 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms