Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Snx29Q9D3S3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Snx29Q9D3S3 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Snx29Q9D3S3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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Snx29Q9D3S3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Snx29Q9D3S3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Snx29Q9D3S3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Snx29Q9D3S3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Snx29Q9D3S3 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Snx29Q9D3S3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Snx29Q9D3S3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Snx29Q9D3S3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx29Q9D3S3 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms