Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Spns3Q9D232 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.9 ms