Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T7

Gkn3, Gastrokine-3, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn3Q9D0T7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gkn3Q9D0T7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms