Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hdhd3Q9CYW4 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hdhd3Q9CYW4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms