Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Utp23Q9CX11 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Utp23Q9CX11 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms