Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
NubplQ9CWD8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms