Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Ifnb1-201ENSMUST00000055671 750 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm45114-201ENSMUST00000208280 1349 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms