Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atp5sQ9CRA7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms