Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PsenenQ9CQR7 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms