Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms