Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg3Q9CPX6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms