Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Krt88Q9CPR6 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krt88Q9CPR6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms