Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Smim3Q99PE5 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms