Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms