Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms