Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms