Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apobec3Q99J72 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec3Q99J72 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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