Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Smim11aQ99J19 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Smim11aQ99J19 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Smim11aQ99J19 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Smim11aQ99J19 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Smim11aQ99J19 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Smim11aQ99J19 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Smim11aQ99J19 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Smim11aQ99J19 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Smim11aQ99J19 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Smim11aQ99J19 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Smim11aQ99J19 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Smim11aQ99J19 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Smim11aQ99J19 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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Smim11aQ99J19 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim11aQ99J19 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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