Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rnf144aQ925F3 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms