Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim59Q922Y2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim59Q922Y2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms