Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rhbdd2Q8VEK2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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