Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEH2

Ciz1, CDKN1A-interacting zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciz1Q8VEH2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ciz1Q8VEH2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms