Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hecw1Q8K4P8 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Hecw1Q8K4P8 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Hecw1Q8K4P8 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms